Dr. Aaron Scherzinger
Wissenschaftlicher Mitarbeiter
Tel: +49 251 83 - 32704
scherzinger(AT)wwu.de
Institut für Informatik
Westfälische Wilhelms-Universität Münster
Einsteinstrasse 62
D-48149 Münster
Raum 610
Sprechstunde: nach Vereinbarung
Forschungsschwerpunkte
- Biomedizinische Bildverarbeitung
- Mustererkennung und Maschinelles Lernen
- Wissenschaftliche Visualisierung und Computergrafik
Promotion
Data Exploration in Natural Sciences using Machine Learning and Scientific Visualization
- Betreuer
- Promotionsfach
- Informatik
- Abschlussgrad
- Dr. rer. nat.
- Verleihender Fachbereich
- Fachbereich 10 – Mathematik und Informatik
Preise
- SciVis Contest Award – IEEE VIS: Visualization & Visual Analytics
Lehre
- Projektseminar: Projektseminar: Barista [106120]
(zusammen mit Prof. Dr. Benjamin Risse, Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Sören Klemm, Dominik Drees)
- Seminar: Seminar: Deep Learning [104121]
(zusammen mit Prof. Dr. Benjamin Risse, Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Sören Klemm, Dr. Dimitri Berh) - Projektseminar: Projektseminar: Barista [104120]
(zusammen mit Prof. Dr. Benjamin Risse, Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Sören Klemm, Dominik Drees) - Projektseminar: Projektseminar: Towards Smart 3D Printing [104123]
(zusammen mit Prof. Dr. Benjamin Risse)
- Seminar: Seminar: Maschinelles Lernen und Deep Learning [102117]
(zusammen mit Prof. Dr. Benjamin Risse, Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Sören Klemm, Dr. Dimitri Berh) - Projektseminar: Projektseminar: Barista for Deep Learning-based Bug Tracking [102116]
(zusammen mit Prof. Dr. Benjamin Risse, Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Sören Klemm, Dominik Drees)
- Seminar: Seminar: Maschinelles Lernen und Deep Learning [100122]
(zusammen mit Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Sören Klemm, Dr. Dimitri Berh) - Projektseminar: Projektseminar: Barista - A Rapid Prototyping Tool for Neural Networks [100121]
(zusammen mit Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Sören Klemm, Dominik Drees)
- Vorlesung: Informatik II - Datenstrukturen und Algorithmen [108381]
(zusammen mit ) - Projektseminar: Projektseminar: Barista - A Rapid Prototyping Tool for Neural Networks [108414]
(zusammen mit Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Sören Klemm) - Übungen zur Informatik II - Datenstrukturen und Algorithmen [108382]
(zusammen mit )
- Projektseminar: Projektseminar: Entwicklung einer Rapid Prototyping Oberfläche zum Trainieren und Testen Neuronaler Netze [106268]
(zusammen mit Prof. Dr. Xiaoyi Jiang)
- Vorlesung: Informatik II - Datenstrukturen und Algorithmen [104160]
(zusammen mit ) - Projektseminar: Projektseminar: IEEE SciVis Contest 2016 [104167]
(zusammen mit Dr. Tobias Brix, Prof. Dr. Xiaoyi Jiang, Claas Flint) - Übungen zur Informatik II - Datenstrukturen und Algorithmen [104161]
(zusammen mit )
- Vorlesung/Praktikum: Einführung in die Computergrafik [101350]
(zusammen mit Dr. Dimitar Valkov) - Projektseminar: Projektseminar: IEEE SciVis Contest 2015 [101311]
(zusammen mit Dr. Tobias Brix)
- Projektseminar: Projektseminar: Barista [106120]
Publikationen
- . . ‘Scalable robust graph and feature extraction for arbitrary vessel networks in large volumetric datasets.’ BMC Bioinformatics 22, Nr. 1: 346. doi: 10.1186/s12859-021-04262-w.
- . . ‘GERoMe – a method for evaluating stability of graph extraction algorithms without ground truth.’ IEEE Access 7: 21744–21755. doi: 10.1109/ACCESS.2019.2898754.
- . . ‘Automatic non-invasive heartbeat quantification of Drosophila pupae.’ Computers in Biology and Medicine 93: 189–199.
- . . Data Exploration in Natural Sciences using Machine Learning and Scientific Visualization Dissertationsschrift, Universität Münster.
- . . Barista - a graphical tool for designing and training deep neural networks. arXiv e-print:1802.04626: CoRR.
- . . ‘Three-Dimensional Visualization of the Lymphatic Vasculature.’ In Lymphangiogenesis - Methods and Protocols, edited by , 1–18. Heidelberg: Springer. doi: 10.1007/978-1-4939-8712-2_1.
- . . ‘Multi-class Cell Segmentation using CNNs with F1-measure Loss Function.’ Contributed to the Proc. of 40th German Conference on Pattern Recognition (GCPR), Stuttgart.
- . . ‘An enhanced multi-label random walk for biomedical image segmentation using statistical seed generation.’ Contributed to the Proc. of 18th Int. Confernce on Advanced Concepts for Intelligent Vision Systems (ACIVS), Antwerp, Belgium.
- . . ‘VIPAR, a quantitative approach to 3D-histopathology applied to lymphatic malformations.’ JCI Insight 2, Nr. 16: e93424.
- . . ‘CNN-based background subtraction for long-term in-vial FIM imaging.’ Contributed to the Proc. of 17th Int. Conf. on Computer Analysis of Images and Patterns (CAIP), Ystad, Sweden.
- . ‘Interactive Exploration of Cosmological Dark-Matter Simulation Data.’ IEEE Computer Graphics and Applications 37, Nr. 2: 80–89.
- . . ‘An Efficient Geometric Algorithm for Clipping and Capping Solid Triangle Meshes.’ Contributed to the 12th Joint Conference on Computer Vision, Imaging and Computer Graphics Theory and Applications (VISIGRAPP 2017) - Volume 1: GRAPP, Porto, Portugal.
- . . ‘GERoMe - A novel graph extraction robustness measure.’ Contributed to the Proc. of Int. Workshop on Graph-Based Representations in Pattern Recognition (GbR), Anacapri, Italy.
- . . ‘Statistical permutation-based artery mapping (SPAM): A novel approach to evaluate imaging signals in the vessel wall.’ BMC Medical Imaging 17, Nr. 1: 36:1–36:11.
- . . ‘Automated Segmentation of Immunostained Cell Nuclei in 3D Ultramicroscopy Images.’ Contributed to the Proc. of 38th German Conference on Pattern Recognition (GCPR), Hannover, Germany.
- Contributed to the IEEE Visualization Conference 2015 October 25-30, Chicago, Il, USA. . ‘Visualize the Universe: Interactive Exploration of Cosmological Dark Matter Simulation Data.’
- . . ‘Interactive Position-dependent Customization of Transfer Function Classification Parameters in Volume Rendering.’ Contributed to the Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine, VCBM 2015, Chester, England.
- . . ‘SKInteract: An on-body interaction system based on skin-texture recognition.’ Contributed to the 15th IFIP TC 13 International Conference on Human–Computer Interaction, INTERACT 2015, Bamberg, Deutschland. doi: 10.1007/978-3-319-22723-8_34.