Datenbanken
Hier können einige Datenbanken gefunden werden, die in unserer Forschung verwendet werden.
Muenster BarcodeDB
Die Muenster BarcodeDB ist eine Sammlung von über 1000 Fotos von Barcodes auf verschiedenen Objekten. Bitte beachten Sie die Datei readme.html, wenn Sie diese Daten verwenden möchten.
PedestrianLights
PedestrianLights ist eine Sammlung von Videos zur Erkennung von Fußgängerampeln im Straßenverkehr. Bitte beachten Sie die Datei index.html, wenn Sie diese Daten verwenden möchten.
LCD2A
Die Kollisionsdatenbank (genannt Larvae Collision Dataset 2 Animals; oder LCD2A) beinhaltet 1352 Bildsequenzen mit ca. 159300 Einzelbildern, welche zwei kollidierende Drosophila melanogaster Larven zeigen. Die Bilder wurden mit dem FIM2c System aufgenommen. Für weitere Informationen siehe:
- Enthaltene Datei "readme.txt"
- Risse B., Otto N., Berh D., Jiang X., Kiel M., Klambt C. 2017. "FIM2c: Multicolor, Multipurpose Imaging System to Manipulate and Analyze Animal Behavior." IEEE Transactions on Biomedical Engineering 64, Nr. 3:610-620
- Otto N, Risse B, Berh D, Bittern J, Jiang X, Klämbt C. 2016. "Interactions among Drosophila larvae before and during collision." Scientific Reports 11, Nr. 6: 31564
LCD2t3
Diese Datenbank (genannt "Larvae Collision Dataset 2 to 3" oder LCD2t3) stellt eine verfeinerte Version der Kollisionsdatenbank LCD2A dar. Die Bilder wurden mit dem FIM2c System aufgenommen. Für weitere Informationen siehe
- Enthaltene Datei "readme.txt"
- Michels T, Berh D, Jiang X. 2018. "An RJMCMC-based method for tracking and resolving collisions of Drosophila Larvae." IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 2018 [Akzeptiert].
LCDseg
This dataset (called : Larvae Collision Dataset with Segmentation) represents a collection of colliding Drosophila larvae sequences from the LCD2t3 dataset, where ten 2-larvae collision videos are randomly selected with 1-10, 11-20, . . . , 41-50, and >50 frames, together with nine 3-larvae collision sequences. In total, this dataset contains 69 videos and 2336 frames. All larvae in these frames were manually segmented. For further information please refer to
- The "readme.txt" file included in the archive
- Bian A, Jiang X, Berh D, Risse B (2021) Resolving colliding larvae by fitting ASM to random walker-based pre-segmentations. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 18 (3), p. 1184-1194.
Heartbeat
Die Heartbeat-Datenbank beinhaltet 39 Bildsequenzen mit ca. 52700 Einzelbildern, welche den (arrhythmischen) Herzschlag von Drosophila melanogaster Pupen zeigen. Die Bilder wurden mit dem FIM System aufgenommen. Für weitere Informationen siehe
- Enthaltene Datei "readme.txt"
- Berh D, Scherzinger A, Otto N, Jiang X, Klämbt C, Risse B. 2018. "Automatic non-invasive heartbeat quantification of Drosophila pupae." Computers in Biology and Medicine 93: 189-199.