Bachelor- und Master-Seminar zur WT: Mathematische Biologie
im SS 2012

Termin:	Donnerstags, 14 - 16 Uhr, SR2
Dozent:	Prof. Dr. Matthias Löwe Dr. Felipe Torres
KommVV	Eintrag der Veranstaltung im kommentierten Vorlesungsverzeichnis

Nachrichten

11.07.2012	Morgen Donnerstag den 12.07 treffen wir uns ganz normal unm 14:15, weil der letzte Vortrag ist abgesagt.
08.05.2012	Bitte, alle Studenten das ein Bachelor-Arbeit schreiben moechten, sollten spaeteste bis zum Donnerstag der 10.05 die aufgefuellte Anmeldungsblatt zur Herr Loewe / Frau Kollwitz geben.

Organisation

Das Seminar richtet sich sowohl an Bachelor- als auch an Masterstudenten. Bachelorstudenten können es als Grundlage für eine nachfolgende Bachelorarbeit nutzen. Es werden in verschiedenen Schwierigkeitsgraden populäre Modelle aus modernen Gebieten der mathematischen Biologie und Bioinformatik untersucht. Beispiele dafür sind Proteinfaltung, Phylogenetische Rekonstruktion sowie die Vorhersage, Expression und Regulation von Genen. Grundkenntnisse über Wahrscheinlichkeitstheorie werden vorausgesetzt, Wissen über große Abweichungen, Markov-Ketten und Testtheorie sind erwünscht, aber nicht zwingend erforderlich.

Vorbesprechung:	Die Vorbesprechung hat breits stattgefunden.
Organisatorisches:	Wegen des großen Andrangs bitten wir alle Studenten, die gleichzeitig ein anderes Seminar belegen, ihre Anmeldung zurückzunehmen. Außerdem möchten wir uns vorbehalten, nicht alle angemeldeten Studenten aufnehmen zu können. Die Einteilung der Vorträge wird zum Anfang der Semesterferien stattfinden.
Leistungsnachweis:	Das Seminar wird durch Abgabe einer schriftlichen Ausarbeitung und anschließendem erfolgreichen Abhalten eines Vortrages sowie der Teilnahme an den übrigen Vorträgen bestanden.
Vorabgabe:	Die Ausarbeitung des Vortrags muss bis spätestens zwei Wochen vor dem Vortrag in Form einer pdf-Datei abgegeben werden.
Vortragsvorbereitung:	Zur Vortragsvorbereitung können die in der Feedback-Vorbesprechung zusammengetragenen Hinweise dienen. Eine sehr ausfürliche Liste von Vortragstipps findet sich auch hier.
Feedback:	Bitte lesen Sie sich die Feedback-Regeln gründlich durch und beherzigen Sie sie in den Feedbackrunden nach jedem Vortrag.

Vorträge

Datum	Name	Thema
5.4.2012	Lisa Klein-Schmeinke	Modeling DNA Sequences
12.4.2012	Alime Karadöl	Proteinsequenzen und Substitutionsmatrizen
19.4.2012	Karolina Weber	Global Alignment of Random DNA Sequences
26.4.2012	Nora Steinle	Local Alignment of Random DNA Sequences
5.5.2012	Julian Huene	A Phase Transition for the Score in Matching Random Sequences allowing Deletions
10.5.2012	Leonie Zeune	Signifikanz von Alignment Scores und BLAST
24.5.2012	Hendrik Flasche	Markov Chains and DNA Sequences
29.5.2012	Pringstferien
14.6.2012	Philip Meier	Probabilistic Representation of Gene Regulatory Networks
21.6.2012	Julia Kroos	Probabilistic Boolean Networks
28.6.2012	Joana Grah	Hidden Markov Models and DNA Sequences
05.7.2012	Merle Erpenbeck	Phylogenetic Reconstruction
12.7.2012	Jennifer Flecken	Models of Nucleotide Substitution

Quellen

Im passwortgeschützten Bereich finden Sie alle für das Semlinar benötigten Quellen. Das Passwort werden Sei in Kürze in einer separaten Mail erhalten.

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